就像其他药物一样，来特莫韦在使用过程中也可能引发一系列不良反应或副作用。
成人HSCT患者：最常见的不良事件(来特莫韦组中至少10%的受试者发生，频率至少比安慰剂组高2%)是恶心、腹泻、呕吐、外周水肿、咳嗽、头痛、疲劳和腹痛。
成人肾移植患者：最常见的不良事件(在来特莫韦组中至少有10%的受试者发生，且发生率高于缬更昔洛韦)是腹泻。
儿科患者：儿科患者的不良事件与成人相似。
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参考资料：FDA说明书，FDA更新于2024年05月31日的说明书https://www.accessdata.fda.gov/scripts/cder/daf/index.cfm?event=overview.process&ApplNo=216854
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